軽減措置 不動産取得税 申請忘れでも還付可能な期限と要件

不動産取得税の軽減措置は知らないと数十万円損する可能性も。申請を忘れても5年以内なら還付請求できるのをご存知ですか?通関業務従事者が不動産を購入する際に押さえるべき軽減措置の要件や申請期限、還付手続きを解説します。

軽減措置 不動産取得税

申請を60日以内に出さないと、15万円以上多く払うことになります。

この記事の3ポイント
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軽減措置で税額が大幅ダウン

建物は最大1,200万円控除、土地は評価額半額+減額措置で、条件を満たせば税額がゼロ円になるケースも多数

申請期限は取得後60日

期限を過ぎても5年以内なら還付請求が可能。申告忘れでも返金してもらえる仕組みがある

面積要件は50〜240㎡

住宅部分の延床面積が基準内で、1982年以降の新築または耐震基準適合なら軽減対象になる

軽減措置 不動産取得税の基本的な仕組み


不動産取得税は、土地や建物を取得したときに都道府県が課税する地方税です。税率は本来4%ですが、2027年3月31日までに取得した土地・住宅については3%に軽減されています。
参考)最新版!不動産取得税|軽減措置の税率・要件・申請方法などを完…


計算式は「固定資産税評価額×税率」が基本です。固定資産税評価額は市場価格の約70%程度に設定されているため、3,000万円の物件なら評価額は約2,100万円になります。軽減措置を使わないと、2,100万円×3%=63万円もの税金がかかる計算です。​
宅地の場合は、固定資産税評価額を半分にする特例も適用されます。つまり実質的な税率は1.5%相当になるということですね。
参考)不動産取得税の軽減【2026年】


さらに住宅本体には、新築なら最大1,200万円、長期優良住宅なら1,300万円の控除が受けられます。この控除を適用すると、多くのケースで建物の不動産取得税はゼロ円になります。
参考)不動産取得税の軽減措置 - 福島県ホームページ


軽減措置 不動産取得税の適用要件

住宅の軽減措置を受けるには、延床面積が50㎡以上240㎡以下であることが必須条件です。貸付用のアパートなど戸建て以外の場合は40㎡以上240㎡以下になります。
参考)住宅又は住宅用土地を取得したときの不動産取得税の軽減制度につ…


中古住宅の場合は、築年数の制限があります。1982年1月1日以降に新築された物件、または建築士による耐震基準適合証明がある物件が対象です。つまり新耐震基準を満たしていることが条件ということですね。
参考)不動産取得税は本当に免除できる?免除・非課税・軽減措置の仕組…

土地の軽減措置には、住宅との取得時期に関するルールがあります。土地を先に取得した場合は、取得日から1年以内にその土地上の住宅を取得する必要があります。逆に住宅を先に取得した場合は、住宅取得後1年以内に敷地を取得すればOKです。
参考)【ホームズ】不動産取得税は要件を満たすと軽減あり!


新築住宅用の土地なら、土地取得から3年以内に住宅が建築されていれば軽減対象になります。期限が比較的長めに設定されているのは助かりますね。
参考)不動産取得税の還付方法|軽減措置の要件と申請手続きの完全ガイ…


埼玉県の不動産取得税軽減制度の詳細
各都道府県の税事務所ホームページで、軽減措置の要件と計算例が確認できます。

軽減措置 不動産取得税の申請期限と手続き

軽減措置の申請期限は、不動産取得後60日以内です。「不動産取得申告書」と必要書類を、管轄の都道府県税事務所に提出します。
参考)不動産取得税の申告を忘れた際の、軽減措置の手続きや必要書類に…


必要書類には、登記事項証明書、住宅用家屋証明書、売買契約書の写しなどが含まれます。中古住宅の場合は、耐震基準適合証明書や既存住宅売買瑕疵保険の保険証券が必要になることもあります。
自治体によっては自動的に軽減措置を適用してくれる場合もありますが、確実に適用を受けるには自分で申告することをおすすめします。60日という期限は意外と短いため、引っ越しや登記手続きに追われているうちに過ぎてしまうリスクがあります。​
申請を忘れて納税通知書通りの金額を支払ってしまった場合でも、還付請求が可能です。「不動産取得税減額申請書」に必要書類を添えて税事務所に提出すれば、払いすぎた税金を返してもらえます。
参考)60日を過ぎても不動産取得税の軽減措置は可能?詳細と手続き方…


ただし還付請求の期限は不動産取得から5年以内です。申告忘れに気づいたら、早めに手続きを行う必要があります。
参考)不動産取得税の還付方法について、軽減措置の要件と手続きの確認…


不動産取得税の申告を忘れた際の還付手続き詳細
還付請求の具体的な流れと必要書類の準備方法がまとめられています。

軽減措置 不動産取得税の計算例

新築住宅(延床面積180㎡、評価額1,500万円)と土地(250㎡、評価額3,500万円)を購入した場合の計算例を見てみましょう。
参考)不動産取得税の軽減措置/京都府ホームページ

建物の税額:
(1,500万円 - 1,200万円) × 3% = 9万円​
1,200万円の控除があるため、評価額との差額300万円だけに課税されます。控除額が評価額を上回る物件なら、建物の税額はゼロ円です。
参考)中古住宅の不動産取得税、実はかからないことも。軽減措置のポイ…


土地の税額:
まず宅地評価の特例で評価額が半額になります。3,500万円 × 1/2 = 1,750万円です。​
次に減額措置を計算します。以下のいずれか大きい額が控除されます:


  • 45,000円

  • (土地1㎡あたりの価格 × 住宅の延床面積 × 2) × 3%

この例では後者の方が大きくなるケースが多く、結果的に土地の税額も大幅に減額されます。
軽減措置を使わない場合と比べると、数十万円単位で税額が変わることがわかりますね。

通関業務従事者が不動産購入時に注意すべき独自ポイント

通関業務に従事している方が不動産を購入する場合、転勤や海外赴任の可能性も考慮する必要があります。
単身赴任で家族が住み続ける場合は、「取得者が取得した住宅に居住すること」という要件を満たすかが問題になります。実際には、取得後すぐに入居できなくても、一定期間内に居住する意思があれば認められるケースが多いです。​
ただし投資用や賃貸用として取得する物件は、自己居住用の軽減措置が受けられません。購入目的を明確にしておくことが大切です。
相続で不動産を取得した場合は、不動産取得税自体が非課税になります。これは軽減措置ではなく、そもそも課税対象外という扱いです。相続による取得なら申告も納税も不要ということですね。
参考)不動産取得税が非課税になる5つの非課税枠と軽減措置の考え方|…


事業用不動産を事業承継で取得する場合は、別の特例措置があります。2026年3月31日までに認定を受けた事業譲渡なら、税率が2.5%に軽減されます。通常の3%より0.5ポイント低い税率が適用されるため、事業承継を予定している方は検討する価値があります。
参考)https://www.chusho.meti.go.jp/zaimu/zeisei/tokurei/fudosan.html

災害で不動産が滅失・損壊した場合に代替不動産を取得したときも、減免措置の対象です。取得直後に災害に遭った場合も同様に減免を受けられます。
中小企業庁の事業承継に係る不動産取得税特例
事業用不動産を譲り受ける際の特例措置について、申請手続きと要件が詳しく説明されています。

軽減措置 不動産取得税で失敗しないためのチェックリスト

購入前に必ず行うべきことは、物件の固定資産税評価額の確認です。路線価や自治体が公表する評価倍率を使えば、おおよその評価額が計算できます。税額を事前に試算しておけば、資金計画に組み込めます。
参考)不動産取得税 失敗を防ぐ5つの視点 - 株式会社青山地所

納税通知書は登記から半年ほど経って届くことが多いです。頭金や仲介手数料の支払いが終わって一息ついた頃に請求が来るため、手元資金が不足するケースが典型的な失敗例です。​
軽減措置の「期限」「要件」「書類」の3要素を押さえることが重要です。特に期限管理は見落としがちなので、購入時にスケジュールを組んでおくと安心ですね。​
オンライン申請に対応する都道府県も増えていますが、添付書類の原本提出を求められる場合もあります。コピーの準備や郵送期間を含めて余裕を持ったスケジュールを立てましょう。​
還付請求は5年以内ですが、早めに手続きした方が資金繰りへの影響が少なくなります。申告を忘れたことに気づいたら、すぐに管轄の税事務所に連絡することをおすすめします。
参考)https://areps.co.jp/knowledge/receive-reduction-in-rea-estate-acquisition-tax


免税点という制度もあり、土地なら10万円未満、建築による家屋なら23万円未満、売買などで取得した家屋なら12万円未満の評価額の場合は課税されません。小規模な物置や倉庫などが該当するケースがあります。
参考)不動産取得税、固定資産税の免税点の覚え方|澁谷典彦税理士事務…

確認項目 チェックポイント 期限・基準
📐 面積要件 延床面積50〜240㎡ 購入前に確認
📅 申請期限 取得後60日以内に申告 厳守推奨
🏠 築年数 1982年以降または耐震証明 中古のみ
💰 還付期限 取得から5年以内 申告忘れ時
📄 必要書類 登記証明・契約書など 事前準備


不動産取得税の軽減措置は、知っているかどうかで数十万円の差が出る制度です。通関業務で多忙な日々を送っている方こそ、期限を意識して早めの手続きを心がけましょう。


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改正消費税の内容と考え方: 軽減税率・経過措置・適格請求書等への実務対応!